Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NubplQ9CWD8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NubplQ9CWD8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NubplQ9CWD8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NubplQ9CWD8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NubplQ9CWD8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NubplQ9CWD8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NubplQ9CWD8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NubplQ9CWD8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NubplQ9CWD8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NubplQ9CWD8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NubplQ9CWD8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NubplQ9CWD8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NubplQ9CWD8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NubplQ9CWD8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NubplQ9CWD8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NubplQ9CWD8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NubplQ9CWD8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NubplQ9CWD8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NubplQ9CWD8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NubplQ9CWD8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NubplQ9CWD8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NubplQ9CWD8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NubplQ9CWD8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NubplQ9CWD8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NubplQ9CWD8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NubplQ9CWD8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NubplQ9CWD8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NubplQ9CWD8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NubplQ9CWD8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NubplQ9CWD8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NubplQ9CWD8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NubplQ9CWD8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NubplQ9CWD8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NubplQ9CWD8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NubplQ9CWD8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms