Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smurf1Q9CUN6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms