Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4930553M12RikQ9CUH1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930553M12RikQ9CUH1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms