Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRW3

UPF0538 protein C2orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRW3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CRW3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CRW3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CRW3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9CRW3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9CRW3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms