Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR56

Nkiras2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras2Q9CR56 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nkiras2Q9CR56 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms