Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR41

Hypk, Huntingtin-interacting protein K, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HypkQ9CR41 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HypkQ9CR41 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HypkQ9CR41 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HypkQ9CR41 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HypkQ9CR41 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HypkQ9CR41 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HypkQ9CR41 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HypkQ9CR41 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HypkQ9CR41 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HypkQ9CR41 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HypkQ9CR41 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HypkQ9CR41 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HypkQ9CR41 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HypkQ9CR41 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HypkQ9CR41 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HypkQ9CR41 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HypkQ9CR41 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HypkQ9CR41 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HypkQ9CR41 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HypkQ9CR41 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HypkQ9CR41 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HypkQ9CR41 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HypkQ9CR41 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HypkQ9CR41 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HypkQ9CR41 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HypkQ9CR41 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HypkQ9CR41 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HypkQ9CR41 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HypkQ9CR41 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HypkQ9CR41 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HypkQ9CR41 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HypkQ9CR41 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HypkQ9CR41 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HypkQ9CR41 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HypkQ9CR41 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HypkQ9CR41 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HypkQ9CR41 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HypkQ9CR41 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HypkQ9CR41 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HypkQ9CR41 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HypkQ9CR41 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HypkQ9CR41 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HypkQ9CR41 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HypkQ9CR41 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HypkQ9CR41 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HypkQ9CR41 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HypkQ9CR41 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HypkQ9CR41 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HypkQ9CR41 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HypkQ9CR41 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HypkQ9CR41 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HypkQ9CR41 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HypkQ9CR41 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HypkQ9CR41 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HypkQ9CR41 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HypkQ9CR41 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HypkQ9CR41 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HypkQ9CR41 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HypkQ9CR41 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HypkQ9CR41 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HypkQ9CR41 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HypkQ9CR41 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HypkQ9CR41 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HypkQ9CR41 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HypkQ9CR41 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HypkQ9CR41 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HypkQ9CR41 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HypkQ9CR41 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HypkQ9CR41 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HypkQ9CR41 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HypkQ9CR41 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HypkQ9CR41 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HypkQ9CR41 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HypkQ9CR41 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HypkQ9CR41 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HypkQ9CR41 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HypkQ9CR41 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HypkQ9CR41 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HypkQ9CR41 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HypkQ9CR41 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HypkQ9CR41 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HypkQ9CR41 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HypkQ9CR41 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HypkQ9CR41 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HypkQ9CR41 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HypkQ9CR41 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HypkQ9CR41 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HypkQ9CR41 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HypkQ9CR41 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HypkQ9CR41 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HypkQ9CR41 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HypkQ9CR41 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HypkQ9CR41 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HypkQ9CR41 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HypkQ9CR41 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HypkQ9CR41 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HypkQ9CR41 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HypkQ9CR41 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HypkQ9CR41 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HypkQ9CR41 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms