Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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Atp5f1Q9CQQ7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Atp5f1Q9CQQ7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp5f1Q9CQQ7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp5f1Q9CQQ7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms