Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM5

Txndc17, Thioredoxin domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txndc17Q9CQM5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Txndc17Q9CQM5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Txndc17Q9CQM5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Txndc17Q9CQM5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Txndc17Q9CQM5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Txndc17Q9CQM5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Txndc17Q9CQM5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms