Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Commd4Q9CQ02 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Commd4Q9CQ02 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms