Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlhe41Q99PV5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms