Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim26Q99PN3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim26Q99PN3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms