Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tsnaxip1Q99P25 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tsnaxip1Q99P25 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms