Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB1

Acss1, Acetyl-coenzyme A synthetase 2-like, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acss1Q99NB1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acss1Q99NB1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms