Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Abcf2Q99LE6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcf2Q99LE6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms