Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Pagr1aQ99L02 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pagr1aQ99L02 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms