Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU1

Dhdds, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Dhdds, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DhddsQ99KU1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DhddsQ99KU1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DhddsQ99KU1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms