Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lactb2Q99KR3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lactb2Q99KR3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms