Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlgn1Q99K10 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nlgn1Q99K10 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms