Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Rnf144aQ925F3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Rnf144aQ925F3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf144aQ925F3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rnf144aQ925F3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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