Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prpf3Q922U1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Prpf3Q922U1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms