Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZD5

Cts3, Cathepsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cts3Q91ZD5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cts3Q91ZD5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cts3Q91ZD5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms