Protein–RNA interactions for Protein: Q91YE8

Synpo2, Synaptopodin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Synpo2Q91YE8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Synpo2Q91YE8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Synpo2Q91YE8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms