Protein–RNA interactions for Protein: Q91X60

Chrna2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna2Q91X60 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chrna2Q91X60 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chrna2Q91X60 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chrna2Q91X60 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chrna2Q91X60 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chrna2Q91X60 2810049E08Rik-201ENSMUST00000185600 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chrna2Q91X60 Gm9931-201ENSMUST00000193584 1185 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Chrna2Q91X60 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Chrna2Q91X60 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chrna2Q91X60 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chrna2Q91X60 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Chrna2Q91X60 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chrna2Q91X60 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chrna2Q91X60 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chrna2Q91X60 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chrna2Q91X60 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chrna2Q91X60 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrna2Q91X60 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrna2Q91X60 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrna2Q91X60 A430018G15Rik-201ENSMUST00000124210 1314 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrna2Q91X60 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrna2Q91X60 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrna2Q91X60 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrna2Q91X60 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrna2Q91X60 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrna2Q91X60 Olfr619-201ENSMUST00000098196 1124 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrna2Q91X60 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrna2Q91X60 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrna2Q91X60 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrna2Q91X60 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrna2Q91X60 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrna2Q91X60 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrna2Q91X60 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrna2Q91X60 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrna2Q91X60 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chrna2Q91X60 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrna2Q91X60 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrna2Q91X60 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrna2Q91X60 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrna2Q91X60 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrna2Q91X60 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrna2Q91X60 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrna2Q91X60 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrna2Q91X60 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrna2Q91X60 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrna2Q91X60 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrna2Q91X60 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrna2Q91X60 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrna2Q91X60 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrna2Q91X60 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrna2Q91X60 AC163038.1-201ENSMUST00000223632 1142 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrna2Q91X60 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrna2Q91X60 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrna2Q91X60 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrna2Q91X60 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrna2Q91X60 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrna2Q91X60 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrna2Q91X60 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chrna2Q91X60 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chrna2Q91X60 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chrna2Q91X60 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chrna2Q91X60 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chrna2Q91X60 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chrna2Q91X60 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrna2Q91X60 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrna2Q91X60 Gm13658-201ENSMUST00000135329 929 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrna2Q91X60 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrna2Q91X60 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrna2Q91X60 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrna2Q91X60 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrna2Q91X60 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrna2Q91X60 Gm36966-201ENSMUST00000192217 413 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrna2Q91X60 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrna2Q91X60 AC173482.2-201ENSMUST00000224044 750 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrna2Q91X60 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrna2Q91X60 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrna2Q91X60 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrna2Q91X60 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrna2Q91X60 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrna2Q91X60 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrna2Q91X60 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrna2Q91X60 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrna2Q91X60 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrna2Q91X60 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrna2Q91X60 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrna2Q91X60 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrna2Q91X60 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrna2Q91X60 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrna2Q91X60 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chrna2Q91X60 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chrna2Q91X60 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chrna2Q91X60 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chrna2Q91X60 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chrna2Q91X60 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chrna2Q91X60 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chrna2Q91X60 Esp18-201ENSMUST00000179848 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chrna2Q91X60 Gm37215-201ENSMUST00000194927 1259 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Chrna2Q91X60 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chrna2Q91X60 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chrna2Q91X60 Zmym2-202ENSMUST00000223669 1281 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms