Protein–RNA interactions for Protein: Q91VT1

Nsmce2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce2Q91VT1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nsmce2Q91VT1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nsmce2Q91VT1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms