Protein–RNA interactions for Protein: Q91VH2

Snx9, Sorting nexin-9, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx9Q91VH2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx9Q91VH2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx9Q91VH2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx9Q91VH2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx9Q91VH2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx9Q91VH2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx9Q91VH2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx9Q91VH2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx9Q91VH2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snx9Q91VH2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx9Q91VH2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx9Q91VH2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx9Q91VH2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx9Q91VH2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx9Q91VH2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx9Q91VH2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx9Q91VH2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx9Q91VH2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx9Q91VH2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx9Q91VH2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx9Q91VH2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx9Q91VH2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx9Q91VH2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx9Q91VH2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snx9Q91VH2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx9Q91VH2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx9Q91VH2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx9Q91VH2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx9Q91VH2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx9Q91VH2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx9Q91VH2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx9Q91VH2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx9Q91VH2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx9Q91VH2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx9Q91VH2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx9Q91VH2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx9Q91VH2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx9Q91VH2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx9Q91VH2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx9Q91VH2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx9Q91VH2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx9Q91VH2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snx9Q91VH2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx9Q91VH2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx9Q91VH2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx9Q91VH2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx9Q91VH2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx9Q91VH2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx9Q91VH2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx9Q91VH2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx9Q91VH2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx9Q91VH2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx9Q91VH2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx9Q91VH2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx9Q91VH2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx9Q91VH2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snx9Q91VH2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx9Q91VH2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx9Q91VH2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snx9Q91VH2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx9Q91VH2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx9Q91VH2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx9Q91VH2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx9Q91VH2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx9Q91VH2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx9Q91VH2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx9Q91VH2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx9Q91VH2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx9Q91VH2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx9Q91VH2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx9Q91VH2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx9Q91VH2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx9Q91VH2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx9Q91VH2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx9Q91VH2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx9Q91VH2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx9Q91VH2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx9Q91VH2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx9Q91VH2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx9Q91VH2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx9Q91VH2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx9Q91VH2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx9Q91VH2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx9Q91VH2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx9Q91VH2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx9Q91VH2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx9Q91VH2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx9Q91VH2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx9Q91VH2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx9Q91VH2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx9Q91VH2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx9Q91VH2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx9Q91VH2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx9Q91VH2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx9Q91VH2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx9Q91VH2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx9Q91VH2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx9Q91VH2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx9Q91VH2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx9Q91VH2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms