Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Stx18Q8VDS8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms