Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fyco1Q8VDC1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fyco1Q8VDC1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fyco1Q8VDC1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fyco1Q8VDC1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fyco1Q8VDC1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fyco1Q8VDC1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fyco1Q8VDC1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fyco1Q8VDC1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fyco1Q8VDC1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fyco1Q8VDC1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fyco1Q8VDC1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fyco1Q8VDC1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fyco1Q8VDC1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fyco1Q8VDC1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fyco1Q8VDC1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fyco1Q8VDC1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fyco1Q8VDC1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fyco1Q8VDC1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fyco1Q8VDC1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Fyco1Q8VDC1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fyco1Q8VDC1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fyco1Q8VDC1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fyco1Q8VDC1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fyco1Q8VDC1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fyco1Q8VDC1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fyco1Q8VDC1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fyco1Q8VDC1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fyco1Q8VDC1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fyco1Q8VDC1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fyco1Q8VDC1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fyco1Q8VDC1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fyco1Q8VDC1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fyco1Q8VDC1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fyco1Q8VDC1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Fyco1Q8VDC1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fyco1Q8VDC1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fyco1Q8VDC1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fyco1Q8VDC1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fyco1Q8VDC1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fyco1Q8VDC1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fyco1Q8VDC1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fyco1Q8VDC1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fyco1Q8VDC1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fyco1Q8VDC1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fyco1Q8VDC1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fyco1Q8VDC1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fyco1Q8VDC1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fyco1Q8VDC1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fyco1Q8VDC1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fyco1Q8VDC1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fyco1Q8VDC1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fyco1Q8VDC1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fyco1Q8VDC1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fyco1Q8VDC1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fyco1Q8VDC1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fyco1Q8VDC1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Fyco1Q8VDC1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fyco1Q8VDC1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fyco1Q8VDC1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fyco1Q8VDC1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fyco1Q8VDC1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fyco1Q8VDC1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fyco1Q8VDC1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fyco1Q8VDC1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fyco1Q8VDC1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fyco1Q8VDC1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fyco1Q8VDC1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fyco1Q8VDC1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fyco1Q8VDC1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fyco1Q8VDC1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fyco1Q8VDC1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fyco1Q8VDC1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fyco1Q8VDC1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Fyco1Q8VDC1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fyco1Q8VDC1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fyco1Q8VDC1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fyco1Q8VDC1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fyco1Q8VDC1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fyco1Q8VDC1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fyco1Q8VDC1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fyco1Q8VDC1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fyco1Q8VDC1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fyco1Q8VDC1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fyco1Q8VDC1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Fyco1Q8VDC1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fyco1Q8VDC1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fyco1Q8VDC1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fyco1Q8VDC1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fyco1Q8VDC1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Fyco1Q8VDC1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fyco1Q8VDC1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fyco1Q8VDC1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fyco1Q8VDC1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fyco1Q8VDC1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fyco1Q8VDC1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fyco1Q8VDC1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fyco1Q8VDC1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fyco1Q8VDC1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fyco1Q8VDC1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms