Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ApobrQ8VBT6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms