Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1T1

Chmp7, Charged multivesicular body protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp7Q8R1T1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Chmp7Q8R1T1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chmp7Q8R1T1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chmp7Q8R1T1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chmp7Q8R1T1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chmp7Q8R1T1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chmp7Q8R1T1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chmp7Q8R1T1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chmp7Q8R1T1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chmp7Q8R1T1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chmp7Q8R1T1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chmp7Q8R1T1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chmp7Q8R1T1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chmp7Q8R1T1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chmp7Q8R1T1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp7Q8R1T1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp7Q8R1T1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp7Q8R1T1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp7Q8R1T1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp7Q8R1T1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp7Q8R1T1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp7Q8R1T1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp7Q8R1T1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp7Q8R1T1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp7Q8R1T1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp7Q8R1T1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp7Q8R1T1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp7Q8R1T1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chmp7Q8R1T1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms