Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Casc3Q8K3W3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casc3Q8K3W3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casc3Q8K3W3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casc3Q8K3W3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casc3Q8K3W3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casc3Q8K3W3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Casc3Q8K3W3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casc3Q8K3W3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casc3Q8K3W3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casc3Q8K3W3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casc3Q8K3W3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casc3Q8K3W3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casc3Q8K3W3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Casc3Q8K3W3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Casc3Q8K3W3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casc3Q8K3W3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Casc3Q8K3W3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casc3Q8K3W3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Casc3Q8K3W3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms