Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrtm1Q8K377 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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