Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrrdQ8K2M3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrrdQ8K2M3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SrrdQ8K2M3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SrrdQ8K2M3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrrdQ8K2M3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrrdQ8K2M3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SrrdQ8K2M3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SrrdQ8K2M3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrrdQ8K2M3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms