Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Brd3Q8K2F0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Brd3Q8K2F0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms