Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Fcho1Q8K285 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms