Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E0

Stx5, Syntaxin-5, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx5Q8K1E0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Stx5Q8K1E0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Stx5Q8K1E0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms