Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FgbQ8K0E8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FgbQ8K0E8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms