Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW4

Cpne5, Copine-5, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne5Q8JZW4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cpne5Q8JZW4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cpne5Q8JZW4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms