Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ercc8Q8CFD5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ercc8Q8CFD5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ercc8Q8CFD5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ercc8Q8CFD5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ercc8Q8CFD5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ercc8Q8CFD5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ercc8Q8CFD5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ercc8Q8CFD5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ercc8Q8CFD5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ercc8Q8CFD5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ercc8Q8CFD5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ercc8Q8CFD5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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