Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp27Q8CEG8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp27Q8CEG8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp27Q8CEG8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp27Q8CEG8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp27Q8CEG8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Usp27Q8CEG8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp27Q8CEG8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp27Q8CEG8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp27Q8CEG8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
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Usp27Q8CEG8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp27Q8CEG8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Usp27Q8CEG8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp27Q8CEG8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Usp27Q8CEG8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp27Q8CEG8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp27Q8CEG8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp27Q8CEG8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp27Q8CEG8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp27Q8CEG8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp27Q8CEG8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp27Q8CEG8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp27Q8CEG8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp27Q8CEG8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Usp27Q8CEG8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Usp27Q8CEG8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp27Q8CEG8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Usp27Q8CEG8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp27Q8CEG8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp27Q8CEG8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Usp27Q8CEG8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Usp27Q8CEG8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Usp27Q8CEG8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp27Q8CEG8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp27Q8CEG8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
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Usp27Q8CEG8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp27Q8CEG8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp27Q8CEG8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp27Q8CEG8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp27Q8CEG8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp27Q8CEG8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp27Q8CEG8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp27Q8CEG8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp27Q8CEG8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp27Q8CEG8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp27Q8CEG8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp27Q8CEG8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
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