Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE47

Slc49a3, Solute carrier family 49 member A3, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc49a3Q8CE47 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc49a3Q8CE47 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc49a3Q8CE47 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc49a3Q8CE47 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc49a3Q8CE47 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc49a3Q8CE47 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc49a3Q8CE47 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc49a3Q8CE47 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc49a3Q8CE47 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc49a3Q8CE47 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc49a3Q8CE47 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc49a3Q8CE47 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc49a3Q8CE47 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc49a3Q8CE47 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc49a3Q8CE47 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc49a3Q8CE47 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc49a3Q8CE47 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc49a3Q8CE47 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc49a3Q8CE47 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc49a3Q8CE47 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc49a3Q8CE47 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc49a3Q8CE47 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc49a3Q8CE47 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc49a3Q8CE47 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc49a3Q8CE47 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc49a3Q8CE47 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc49a3Q8CE47 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc49a3Q8CE47 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc49a3Q8CE47 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc49a3Q8CE47 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc49a3Q8CE47 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc49a3Q8CE47 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc49a3Q8CE47 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc49a3Q8CE47 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc49a3Q8CE47 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc49a3Q8CE47 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc49a3Q8CE47 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc49a3Q8CE47 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc49a3Q8CE47 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc49a3Q8CE47 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc49a3Q8CE47 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc49a3Q8CE47 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc49a3Q8CE47 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc49a3Q8CE47 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc49a3Q8CE47 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc49a3Q8CE47 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc49a3Q8CE47 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc49a3Q8CE47 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc49a3Q8CE47 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc49a3Q8CE47 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc49a3Q8CE47 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc49a3Q8CE47 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc49a3Q8CE47 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc49a3Q8CE47 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc49a3Q8CE47 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc49a3Q8CE47 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc49a3Q8CE47 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc49a3Q8CE47 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc49a3Q8CE47 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc49a3Q8CE47 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc49a3Q8CE47 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc49a3Q8CE47 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc49a3Q8CE47 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc49a3Q8CE47 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc49a3Q8CE47 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc49a3Q8CE47 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc49a3Q8CE47 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc49a3Q8CE47 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc49a3Q8CE47 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc49a3Q8CE47 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc49a3Q8CE47 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc49a3Q8CE47 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc49a3Q8CE47 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc49a3Q8CE47 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc49a3Q8CE47 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc49a3Q8CE47 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc49a3Q8CE47 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc49a3Q8CE47 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc49a3Q8CE47 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc49a3Q8CE47 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc49a3Q8CE47 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc49a3Q8CE47 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc49a3Q8CE47 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc49a3Q8CE47 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc49a3Q8CE47 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc49a3Q8CE47 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc49a3Q8CE47 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc49a3Q8CE47 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc49a3Q8CE47 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc49a3Q8CE47 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc49a3Q8CE47 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc49a3Q8CE47 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc49a3Q8CE47 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc49a3Q8CE47 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc49a3Q8CE47 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc49a3Q8CE47 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc49a3Q8CE47 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc49a3Q8CE47 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc49a3Q8CE47 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc49a3Q8CE47 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms