Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBG9

Rnf170, E3 ubiquitin-protein ligase RNF170, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf170Q8CBG9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf170Q8CBG9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf170Q8CBG9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms