Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Lrrn3Q8CBC6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrn3Q8CBC6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms