Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9C9

4930507D05Rik, RIKEN cDNA 4930507D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930507D05RikQ8C9C9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
4930507D05RikQ8C9C9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms