Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssuh2Q8C3L1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ssuh2Q8C3L1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssuh2Q8C3L1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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