Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube3dQ8BX13 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube3dQ8BX13 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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