Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTQ0

PcgF3, Polycomb group RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcgF3Q8BTQ0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PcgF3Q8BTQ0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms