Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ73

Rspo4, R-spondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo4Q8BJ73 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rspo4Q8BJ73 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms