Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rufy1Q8BIJ7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy1Q8BIJ7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms