Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHK2

Scn3b, Sodium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3bQ8BHK2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scn3bQ8BHK2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms