Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGH4

Reep1, Receptor expression-enhancing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep1Q8BGH4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Reep1Q8BGH4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Reep1Q8BGH4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Reep1Q8BGH4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Reep1Q8BGH4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Reep1Q8BGH4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Reep1Q8BGH4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Reep1Q8BGH4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Reep1Q8BGH4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Reep1Q8BGH4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Reep1Q8BGH4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Reep1Q8BGH4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms